Tehnologiile de secvențiere de ultimă generație (NGS) pentru detectarea agenților patogeni

Industria alimentară de astăzi se concentrează pe transparență și pe o mai bună înțelegere a focarelor de origine alimentară pentru a preveni mai degrabă decât pentru a trata. Tehnologiile de secvențiere de ultimă generație (NGS) pentru detectarea agenților patogeni și identificarea tulpinilor sunt dezvoltări recente ale tehnologiei de testare a siguranței alimentelor în industria alimentară, pentru a răspunde acestor nevoi.

Costul, scalabilitatea, timpul de adunare a rezultatelor și acuratețea sunt considerații cheie pentru producători și consumatori și, prin urmare, pentru industria alimentară atunci când vine vorba de asigurarea siguranței alimentelor.

Procesele robuste și în mai multe etape, care se concentrează pe monitorizarea punctelor critice de control, monitorizarea mediului și detectarea agenților patogeni în alimente sunt, de asemenea, aplicate pentru a stabili siguranța alimentelor.

„În ceea ce privește microbiologie, siguranța alimentelor înseamnă absența microorganismelor patogene”, a spus dr. Andrew Lin, om de știință la Clear Labs. Consumatorii de astăzi se așteaptă la transparență. Ei speră, de asemenea, că industria alimentară folosește măsuri eficiente de control pentru a se asigura că alimentele pe care le vând sunt lipsite de agenți patogeni, a adăugat Lin.

Industria alimentară folosește diverse măsuri pentru a reduce riscul apariției agenților patogeni în alimentele lor, inclusiv aciditatea, temperatura, timpul, oxigenul și umiditatea, spune Lin. Testarea de rutină pentru agenți patogeni este un aspect cheie pentru asigurarea siguranței alimentelor. „ Conceptul Hurdle este că utilizarea mai multor măsuri de control reduce și mai mult riscul de apariție a agenților patogeni”, a explicat Lin.

Utilizarea unui sistem de analiză a pericolelor și a punctelor critice de control (HACCP) pentru a analiza procesul și a implementa controale adecvate pentru a asigura siguranța alimentelor este, de asemenea, vitală. Lin notează că firmele trebuie, de asemenea, să ia în considerare reglementările și să dezvolte programe robuste de monitorizare a mediului.

În Europa, Comisia Europeană afirmă că procedurile bazate pe principiile (HACCP) sunt obligatorii pentru majoritatea întreprinderilor care operează cu alimente sau furaje. „Sunt esențiale pentru a pune în aplicare, implementa și menține un sistem de management al siguranței alimentelor, protejând consumatorii de pericole”, afirmă Comisia Europeană, referindu-se la principiile HACCP.

Evoluția tehnologiei de testare

Pandemia de COVID-19 a afectat spațiul tehnologic de testare a siguranței alimentelor, a spus Lin, deoarece a pus o mare parte din forța de muncă sub stres. Drept urmare, companiile s-au luptat cu asigurarea de personal, în special în domeniile care necesită o expertiză și o formare specială, cum ar fi tehnicienii de laborator. Eficiența și acuratețea sunt acum componente cruciale ale proceselor necesare pentru a garanta siguranța alimentelor.

Mai multe tehnici, inclusiv PCR, qPCR, RT-PCR și LAMP, pot detecta acizi nucleici și altele, în special ELISA, ELFA și fluxul lateral pentru detectarea pe bază de anticorpi. Tehnologia siguranței alimentelor identifică, de asemenea, tulpinile în care intervin secvențierea și NGS. Alte forme de tehnologie includ serotiparea tradițională, MLST, PFGE, matrice ADN etc..

Clear Labs se concentrează pe accelerarea adoptării NGS, astfel încât mai mulți oameni să îl poată utiliza pentru analize și perspective mai profunde. NGS se străduiește să ofere informații mai precise și complete asupra testării siguranței alimentelor.

Explorarea tehnologiilor avansate

Clear Labs se concentrează pe înțelegerea genomicii bolilor infecțioase prin tehnologia de testare a siguranței alimentelor. Aplicând cunoștințele sale despre secvențierea ADN-ului, Clear Labs și-a dezvoltat serviciul de secvențiere, Clear Transparency. Serviciul său este conceput pentru a ajuta comercianții cu amănuntul și consumatorii să știe ce conțin produsele pe care le cumpără și de unde provin.

Furnizorul de platforme de secvențiere automată pentru diagnosticare s-a axat apoi pe dezvoltarea tehnologiei NGS pentru a răspunde altor nevoi alimentare ale clienților, inclusiv detectarea agenților patogeni.

„În timp ce alte tehnici rapide, cum ar fi PCR sau ELISA, ar putea detecta agenți patogeni în alimente, tehnologia NGS a Clear Labs a generat milioane de citiri, acoperind mai mulți markeri genetici per agent patogen”, a spus Lin.

Prin dezvoltarea platformei sale cu redundanță încorporată, Clear Labs afirmă că produsele sale de detectare a agenților patogeni sunt mai fiabile, reducând rezultatele fals-negative și fals-pozitive și oferă mai multe informații, cum ar fi detalii despre serotip sau tulpină.

Cu platforma sa automatizată, Clear Labs poate efectua NGS și analize de date pentru a furniza automatizare și pentru a reduce erorile, sporind în același timp repetabilitatea și robustețea, cu mai puțină expertiză și instruire pentru a reduce timpul de practică la între 30 de minute și o oră.

Furnizorul de platforme automate NGS pentru diagnosticare oferă testare Clear Safety pentru salmonella care detectează și identifică serotipurile, în timp ce testarea Clear Safety listeria detectează și identifică specii și efectuează analize de similitudine ale diferitelor tulpini de listeria.

Având încredere în tehnologia de testare

Comentând despre cea mai importantă provocare de astăzi în aplicarea tehnologiilor de testare a siguranței alimentelor, Lin a declarat: „Există reticenț ale unor actori din industrie de a adopta noi tehnologii, având în vedere investiția sau formarea personalului cu privire la noi metode.”. Lin adaugă că industria trebuie să dezvolte „rapid soluții precise și rentabile pentru producători și comercianți”​ pentru a depăși acest obstacol.

În 2022, Clear Labs își concentrează eforturile în materie de siguranță alimentară pe punerea în valoare a genomicii, făcând tehnologia NGS mai accesibilă. De asemenea, intenționează să se concentreze pe optimizarea fluxului de lucru și a automatizării analizei datelor pentru a reduce punctele dureroase pentru consumatorii ezitanți.